工業殺菌劑是在工業領域中用以殺滅和(或)抑制微生物生長的制劑。就使用范圍而言，目前的殺菌劑主要應用在農業、醫學和工業三個方面。農用殺菌劑主要包括有農藥、獸藥及相關的品種;醫用殺菌劑則主要有藥物、(空氣、器械、用品)消毒劑等。除此以外，其他殺菌劑都基本可以歸為工業殺菌劑的范疇。
不過，對于某一種殺菌劑來說，其歸屬并不都是惟一的、固定的。有的殺菌劑既可以用于農業方而，也可用在工業方面或醫學方面，反之亦然；有的殺菌劑起初時僅在一個領域中使用，但以后也可能拓展到其他領域中去。百菌清作為農藥可以用于防治多種植物病害，而在工業防霉上也曾經擔當過一個重要角色；某些用于醫院手術室和病房的空氣消毒劑，也常常用在食品廠、制藥廠、化妝品廠的環境水質消毒上。許多抗菌素最早是在醫學上發現和使用的而現在，用于農業上某些作物病害和禽畜病害的防治，用于發酵工業控制有害雜菌的污染的例子也已經很多很多。著名的殺菌劑噻苯咪唑，早期是作為一種醫用的驅蟲劑做臨床使用的，后來發現其在植物體上的內吸作用和防病效果，成為農業上一種有代表性的內吸性殺菌劑，由于同時具有廣譜、高效、低毒、穩定等工業殺菌劑所要求的特點，20世紀80年代起已逐步發展成為一種使用廣泛的優良工業殺菌劑.
不過，在殺菌劑的實際應用時，由于使用對象、環境條件、目標微生物種類和數量的差異等原因，這個“閾值”是很難掌握的。然而，在安全使用量的情況下，多數殺菌劑并不能（通常也無必要）把微生物全部殺死。
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